És recomanable tenir les bases de dades carregades per facilitar la lectura dels codis dels productes.
Per procedir a l'actualització de les diferents bases de dades és necessari:
En primer lloc, carregar les bases de dades per mitjà del suport subministrat pel fabricant o majorista (sigui amb un CD/DVD o baixat d'Internet).
Automàticament es crearà una carpeta que s'allotjarà dins del nostre ordinador.
Exemples:
C:/BCB (en el cas de RESIP)
C:/CONSEJO(en el cas de CONSEJO)
En segon lloc, un cop carregada la base de dades al nostre ordinador, cal incorporar-la a la base de dades de l'Andofarma3®. Així, les dades i preus dels productes continguts a l'Andofarma3 quedaran actualitzats.
A través del programa Andofarma3® (Utilitats/Configuració Empresa), a la pestanya BASE DE DADES, podem indicar al programa on és la carpeta que s'ha creat amb la càrrega de la base de dades. És important configurar la ruta exacta per poder executar l'actualització en el següent pas.
Un cop indicada la ruta, cal prémer 
perquè quedi gravada, així no caldrà introduir-la de nou quan vulguem actualitzar la base de dades.
A través del programa Andofarma3® podrem posar en marxa l'actualització de la base de dades seleccionada. És recomanable fer-ho quan no hi ha massa feina a la tenda doncs podria alentir el rendiment dels ordinadors.